سنگ بنای تشکیل بنیاد مستضعفان بر پایه فرمان 09/12/1357 رهبر کبیر انقلاب و بنیانگذار جمهوری اسلامی ایران، حضرت امام خمینی(ره) خطاب به شورای انقلاب اسلامی، با هدف تجمیع اموال و داراییهای مصادره شده از خاندان پهلوی و وابستگان دربار و تخصیص این داراییها به مستمندان، نهاده شد.
موسسه بنیاد علوی پس از تغییر ساختار معاونت محرومین بنیاد مستضعفان در سال 1384، به عنوان بازوی توانمندسازی محرومین بنیاد مستضعفان تاسیس گردید.
رهبر معظم انقلاب (حفظه الله)، پیرو انتصاب ریاست بنیاد مستضعفان در دوره جدید (مورخ 7/8/1402)، ابلاغیه 14 بندی در پیوست حکم ایشان را صادر نمودند که سه بند آن مرتبط با ماموریتهای بنیاد علوی است.
بر اساس ابلاغیه مقام معظم رهبری (حفظه الله) ، مهمترین مأموریت بنیاد مستضعفان، «توانمندسازی محرومین» تعیین گردیده است. بر مبنای ابلاغیه فوق، اجرایی نمودن مهمترین ماموریت بنیاد مستضعفان بر عهده بنیاد علوی قرار گرفته است.
ریاست بنیاد مستضعفان مبتنی بر حکم رهبر معظم انقلاب اسلامی و سیاست های کلی اقتصاد مقاومتی، به منظور تبیین چارچوب «توانمندسازی محرومین» از ابعاد اقتصادی، جسمانی، فکری-آموزشی، سند «نگاه راهبردی به بنیاد علوی با رویکرد تحولی» را به شماره 203938/10 مورخ 08/09/1402 به بنیاد علوی ابلاغ نمودند که مبنای تدوین برنامه های عملیاتی، اصلاح ساختار سازمانی و انجام اقدامات لازم در خدمات رسانی به اقشار ضعیف، محرومان و مستضعفان قرار گیرد.